"Wiem, że nie można stosować ulgi 30tyś w pracy i w działalności." - Obecnie nie jest to zabronione. Można stosować tu i tu, ale będzie się pewnie wiązało to z dopłatą w zeznaniu rocznym.

"Natomiast jest jakaś różnica w rozliczeniu rocznym, gdzie lepiej ją stosować?" - W trakcie roku trzeba stosować w działalności. Tu nie ma opcji z jej rezygnacji.