Trzeba zrobić korektę PIT-39.
Wyliczyć należny podatek wg wzoru..
Przykład:
Przychód z odpłatnego zbycia 200.000 zł.
Koszty uzyskania przychodu 150.000 zł.
Dochód 50.000 zł.
Wydatki poniesione na cele mieszkaniowe 180.000 zł.
Obliczenie dochodu podlegającego zwolnieniu:
(50.000 zł x 180.000zł) / 200.000 zł = 45.000 zł.
Dochód podlegający zwolnieniu 45.000 zł.
Do opodatkowania pozostaje dochód w kwocie 5.000 zł. (50.000 zł – 45.000 zł).

U Ciebie podstawa obliczenia podatku = 9664, podatek = 1836 ,00 zł.
Oczywiście należy jeszcze doliczyć odsetki ....